Лікування чоловічого безпліддя спрямовано на усунення його причин. Необхідно вилікувати запальні захворювання ( простатит , уретрит ), в тому числі захворювання, що передаються статевим шляхом ( хламідіоз , гонорею , уреаплазмоз , трихомоніаз ). Після цього проводяться заходи по поліпшенню кількості і якості сперматозоїдів. Для цього застосовуються спеціальні препарати, вітамінні комплекси (вітаміни груп C і E, полівітаміни) і т.д. Іноді позитивний ефект надає зміна способу життя чоловіки - боротьба зі стресом, позбавлення від шкідливих звичок.
У деяких випадках необхідно хірургічне втручання - лікування варикоцеле , крипторхізму . Важливу роль відіграють операції з відновлення прохідності семявиносящих шляхів. У складних випадках виникає необхідність використання допоміжних репродуктивних технологій (ДРТ). Коли, незважаючи на лікування, чоловік залишається абсолютно безплідним, може бути використана донорська сперма, яка вводиться в матку жінки за допомогою катетера. Ця процедура називається штучної інсемінації. Запліднення може бути проведено з використанням сперми чоловіка в тих випадках, коли безпліддя викликане нездатність сперматозоїдів пройти через шийку матки. Штучна інсемінація дозволяє доставити їх прямо в порожнину матки.
Для подолання чоловічого безпліддя використовується один з видів екстракорпорального запліднення - ІКСІ. Ця сучасна технологія дає можливість стати батьком чоловікам навіть з дуже низькою якістю сперми. При цьому яйцеклітина витягується з організму жінки і запліднюється єдиним сперматозоїдом за допомогою мікроголки. Після цього отриманий ембріон вносять в матку. При звичайному ЕКО використовується сперма, яка містить безліч сперматозоїдів, в той час як для ІКСІ - достатньо одного. В деяких випадках сперматозоїд для ІКСІ отримують навіть не зі сперми, а безпосередньо з придатка яєчка або самого яєчка хірургічним шляхом. Вагітність в результаті процедури настає в 20-60% випадків.