При хронічних гепатитах В і С застосовується противірусна терапія, яка дозволяє значно знизити активність розмноження вірусів, відновити роботу печінки, запобігти формуванню цирозу. Домогтися повного позбавлення від вірусу при гепатиті В, на жаль, можливо тільки в 10-15% випадків. Шансів вилікувати хронічний гепатит С більше - 50-80%. Лікування гепатиту В і С тривале - від 6 місяців і довше.

Лікування хронічних гепатитів В і С включає в себе аналоги нуклеозидів (підміняють нуклеозиди, з яких будується генетичний матеріал вірусу) і інтерферони (активізують боротьбу з вірусом в людських клітинах). Для лікування гепатиту В застосовують нуклеозиди ламівудин і адефовір. При цьому нуклеозиди і інтерферони використовують як окремо, так і в комбінації один з одним. Для лікування гепатиту С застосовують інтерферон-альфа в комбінації з аналогом нуклеозидів рибавірином. Окремо вони не так ефективні. Існує модифікований інтерферон - пегілірований, - який вводять раз на тиждень, а не раз на три дні або щодня. В якості підтримуючої терапії гепатитів В і С призначають гепатопротектори і деякі імуномодулятори (наприклад, задаксін).

Нуклеозиди зазвичай переносяться хворими легко, але при лікуванні інтерфероном не можна уникнути побічних ефектів. Після першої ін'єкції спостерігається грипоподібний синдром - підвищується температура, з'являються болі в м'язах, слабкість. Цей стан триває від декількох годин до 2-3 днів. Протягом місяця організм адаптується до інтерферону, і грипоподібний синдром зникає. Тим не менш, слабкість і стомлюваність зберігаються. На другому-третьому місяці лікування можуть спостерігатися зміни в загальному аналізі крові - знижується кількість лейкоцитів і тромбоцитів. При необхідності знижують дозу інтерферону або переривають лікування, поки не відновляться показники крові. Зниження лейкоцитів може привести до розвитку бактеріальних інфекцій, а тромбоцитів - появі кровотеч. Тому всі пацієнти, що приймають інтерферон, повинні раз на місяць здавати аналіз крові і показуватися лікареві.