Деякі типи вірусу здатні викликати злоякісні (онкологічні) процеси в організмі людини. Особливо це стосується папіломавірусної інфекції сечостатевого тракту. Доведеним є виникнення раку шийки матки у жінок, частіше молодого віку, на тлі протікання папіломавірусної інфекції. Інші онкологічні процеси сечостатевої області в даний час вивчаються на предмет прямого зв'язку з носійство вірусу папіломи людини (ВПЛ).

В даний час у людини описано понад 70 різних папіломавірусів. Різні типи вірусу папіломи людини пов'язані з різними видами уражень шкіри і слизових оболонок. Встановлено, що сечостатеву (урогенітальну) область можуть вражати певні типи папіломавірусів, серед яких виділяють різновиди низького (6, 11, 42, 43, 44), середнього (31, 33, 35, 51, 52, 58) і високого (16, 18, 45, 36, 56, 66) онкологічного ризику.

Клінічні прояви папіломавірусної інфекції геніталій досить різноманітні. Вони можуть представляти із себе вирости (освіти у вигляді бородавок, що нагадують півнячі гребені або кольорову капусту) на поверхні шкіри або слизових оболонок, а також плоскі округлі освіти, не завжди підносяться над поверхнею.

Генітальні кондиломи розташовуються, в основному, в місцях найбільш пошкоджує під час статевого акту: малі статеві губи, піхва, шийка матки, гирло сечовипускального каналу, область ануса, шкірні покриви у жінок. У чоловіків віруси папіломи розташовуються в області крайньої плоті, на голівці статевого члена, в області промежини, на мошонці, рідше, на шкірі лобка і в сечівнику.

Прихований період після зараження складає, в середньому, від 1 до 12 місяців, іноді довше.

У переважній більшості випадків папіломавірусна інфекція поєднується з іншими захворюваннями, що передаються статевим шляхом. Тому більш ніж актуальним є діагностика таких захворювань, як ВІЛ, сифіліс , хламідіоз, гонорея (частіше хронічна), трихомоніаз, уреаплазмоз, мікоплазмоз, гарднерельоз (бактеріальний вагіноз), генітальний герпес та інших, які ускладнюють лікування папіломавірусної інфекції і навпаки.

Необхідно також обов'язкове обстеження і лікування всіх партнерів, з якими хворий папіломавірусною інфекцією мав статеві контакти в останні 12 місяців.

Важливим аспектом є можливість зараження матір'ю своєї дитини під час пологів через природні родові шляхи, якщо вона була інфікована і не проходила лікування.