Образованию кисты способствуют частые хронические риниты и хронические гаймориты, постоянные очаги инфекции при заболеваниях верхних зубов. Кроме того, киста может быть вызвана особенностью строения соустья (выходного отверстия) гайморовой пазухи. Если оно расширено, то в пазуху при дыхании в одну и ту же точку слизистой оболочки ударяет струя воздуха.

В большинстве случаев киста не вызывает никаких симптомов. Обычно ее обнаруживают совершенно случайно при проведении компьютерной томографии по поводу других жалоб или заболеваний. Если киста не беспокоит человека, ее можно не лечить, а только периодически наблюдать.

Но в некоторых случаях киста проявляет себя в виде болей в области верхней челюсти, головной боли, заложенности носа и часто возникающего гайморита, выделения из носа слизистого характера.  Люди, занимающиеся подводным плаванием, могут ощущать дискомфорт в районе кисты при погружении на глубину.

Выраженность проявлений кисты гайморовой пазухи не зависят от ее размеров. Например, бессимптомными могут быть крупные кисты, расположенные в нижних отделах пазухи, тогда как небольшая киста, находящаяся на верхней стенке, в области прохождения второй ветви тройничного нерва, часто вызывает головную боль.