Розрізняють системний мікоз, що поширюється на весь організм, і дерматомікоз, при якому уражаються шкіра, волосся або нігті. Поразки при системному мікозі часто нагадують туберкульоз або запущений сифіліс ; цей вид мікозу протікає важче і може призводити до смерті. Оскільки грибки-збудники легко ідентифікувати, лабораторний діагноз не представляє труднощів.

Кокцідіоідоз (кокцидіоїдомікоз, або каліфорнійська лихоманка) викликається ниткоподібним дріжджовим грибком Coccidioides immitis. Найбільш поширений в південній Каліфорнії, але зустрічається по всьому північний захід США. Передачі інфекції від людини до людини не відбувається. Грибок потрапляє в організм головним чином при вдиханні пилу, що містить його суперечки, але може проникати і через шкіру при контакті з зараженим грунтом. Носіями інфекції вважаються дикі гризуни (наприклад, пацюки). Кокцідіоідоз - гостре захворювання дихальних шляхів, яке, як правило, виліковується мимоволі (без спеціального лікування), а проте іноді захворювання набуває прогресуючу системну форму, яка може привести до летального результату. Спочатку кокцідіоідоз протікає безсимптомно або нагадує грип. Можливі підвищення температури, кашель і біль у грудній клітці з подальшими шкірними висипаннями. Якщо інфекція потрапила в організм через шкіру, то в місці її проникнення утворюються невеликі шкірні нариви. У більшості випадків ці первинні прояви зникають без будь-якого лікування. Іноді ж інфекція проникає в глибокі тканини: кістки, суглоби, мозок і мозкові оболонки, де утворюються гранульоми, пізніше перетворюються в абсцеси або виразки. При цьому підвищується температура тіла, знижується апетит, відбувається швидка втрата ваги і сил. Ефективних засобів лікування цієї форми захворювання не існує. Поширення інфекції кілька затримує препарат амфотерицин.

Гістоплазмоз викликається дрожжеподобним грибком Histoplasma capsulatum, який розмножується в посліді голубів, летючих мишей і курчат. Зустрічається у всьому світі, в США - головним чином в долинах річок Міссісіпі та Огайо. Інфікування відбувається при вдиханні пилу, що містить заражений послід, поїданні забрудненої їжі або через шкіру. В організмі грибок приймає форму внутрішньоклітинного паразита, поселяючись в деяких тканинах і клітинах крові. Первинна інфекція рота, глотки або вух викликає утворення виразок і збільшення прилеглих лімфатичних вузлів. Прояви первинної респіраторної інфекції схожі з симптомами первинного туберкульозу; наприклад, утворюються невеликі вогнища в легенях, але вони зарубцьовуються і кальціфіціруются. Захворювання закінчується мимовільно, шанси на одужання дуже високі. При прогресуючій формі гистоплазмоза грибок проникає у внутрішні органи, в результаті чого печінка і селезінка збільшуються, а в кишечнику утворюються виразки. Часто інфекція поширюється на кістковий мозок; в цьому випадку часом підвищується температура, людина худне, в крові падає вміст еритроцитів і лейкоцитів. Прогресуюча форма захворювання нерідко призводить до швидкої смерті. Амфотерицин уповільнює поширення інфекції.

Бластомікоз (північноамериканський бластомікоз, або хвороба Гілкріст) викликається дрожжеподобним грибком Blastomyces dermatitidis. Це досить рідкісне захворювання, яке носить хронічний характер, може протікати у формі первинних змін, обмежених шкірою або легкими, або поступово вражати весь організм. Природний резервуар грибка-збудника і спосіб його передачі невідомі. Спочатку на обличчі, шиї або кінцівках з'являються невеликі червонуваті вузлики або гнойнички. Збільшуючись у розмірах, вони покриваються скоринкою з дрібними наривами по краях, пізніше деякі перетворюються у виразки. Пошкодження при легеневому бластомікозі нагадують туберкульоз або первинний рак легенів. Грибок може проникати в кістки, печінку, селезінку, нирки і центральну нервову систему, приводячи до появи там пухлиноподібних утворень, які пізніше перетворюються на виразки або абсцеси. Патологічні зміни в центральній нервовій системі можуть викликати параліч. При поширенні інфекції з кісток або внутрішніх органів в легені в них нерідко виникають великі зміни, які призводять до смерті. Шкірний бластомікоз піддається променевої терапії та лікування иодидом калію. Хоча більшість випадків системного або легеневого бластомікоз успішно лікується протигрибковими антибіотиками, часто виникають рецидиви і ймовірність повного одужання невелика.

Криптококоз (торулез, або європейський бластомікоз) - хронічне інфекційне захворювання, що викликається дрожжеподобним грибком Cryptococcus neoformans, який зустрічається в усьому світі і виділений з фруктових соків, молока і голубиного посліду. В організм людини грибок потрапляє через дихальний або травний тракт. Інфекція гніздиться головним чином в мозку і мозкових оболонках, але може проникати в будь-яку частину тіла, викликаючи утворення укритих виразками пухлин і глибоких абсцесів або руйнуючи нервову тканину. Початковими симптомами ураження мозку і мозкових оболонок є головний біль, запаморочення і ригідність (напруженість) м'язів шиї. Пізніше порушуються зір і координація рухів, розвивається параліч. Прогресуючий параліч приводить до смерті. При ураженні легенів дещо підвищується температура, виникає слабкий кашель; зміни в легенях нагадують туберкульоз або рак. З легких інфекція поширюється в головний мозок або на мозкові оболонки. Імовірність одужання мала, ураження мозку і його оболонок завжди виявляється смертельним.

Аспергільоз - інфекційне ураження шкіри, навколоносових пазух і легенів або інших внутрішніх органів, викликаного пліснявими грибками роду Aspergillus, зокрема A. fumigatus. Зараження відбувається в результаті вдихання грибкових спор. Захворювання зустрічається відносно рідко, переважно серед сільськогосподарських робітників і голуб'ятників. Зазвичай уражаються тканини зовнішнього вуха (отомікоз), що супроводжується свербінням і болем; при розчісуванні шкіра може товщати і набувати сірий або чорний колір. Велика кількість спор, потрапляючи в легені, викликає великі зміни, що нагадують туберкульоз. Шкірний аспергільоз добре піддається лікуванню антибіотиками. При легеневої інфекції застосовують амфотерицин. Однак системні ураження іноді призводять до смерті.