Діагностика синдрому роздратованого кишечника грунтується на клінічній картині. Ознаки захворювання - це рецидивуюча біль або дискомфорт у животі, які з'явилися не менше 6 місяців тому і тривають не менше 3 днів в місяць в останні 3 місяці. Крім того, спостерігається два або три з наступних симптомів: біль і неприємні відчуття слабшають після дефекації; поява болю і дискомфорту збіглося за часом зі зміною частоти стільця; поява болю і дискомфорту збіглося за часом зі зміною форми (зовнішнього вигляду) стільця.
Не існує спеціальних аналізів чи тестів для діагностики синдрому подразненого кишечника. По суті, постановка діагнозу грунтується на виключенні інших захворювань, які можуть викликати подібні симптоми. Перш за все, пацієнта перевіряють на наявність гельмінтозу , лактазной недостатності , целіакії , запальних захворювань кишечника (наприклад, хвороби Крона і виразкового коліту ). Хворим призначають аналізи крові і калу, УЗД органів черевної порожнини. Людям старше 50 років рекомендується проведення скринінгової колоноскопії.